生物安全柜是一种在微生物学、生物医学、基因重组、动物实验、生物制品等领域的科研、教学、临床检验和生产中广泛使用的安全设备，也是实验室生物安全中一级别防护屏障基本的安全防护设备。生物安全柜与超净工作台这两种设备常容易被混淆，其实两者之间是有本质区别的。
具体的生物安全柜和超净工作台的区别如下：
1. 生物安全柜是属于一种负压的净化工作台，是生物安全隔离设备，使工作人员以及工作环境免受生物细菌的危害，正确操作生物安全柜，能够保护操作人员的生命安全以及工作环境的安全，保护受试样品并防止交叉污染的发生。而超净工作台所保护的不是工作人员以及工作环境而是操作对象，所以在微生物学、生物医学等领域的科研、教学、生产中，应该选择和使用生物安全柜，而不能够选择和使用超净工作台。
2. 超净工作台作为保护实验室材料而设计的，通过风机把空气吸进预过滤器，通过静压箱进入高效顾虑器进行过滤，把过滤后的空气以垂直或者是水平气流的状态送出，使得操作区域能够达到百级洁净度，以保证工作区域的洁净度要求，只是能够保护样品不能够保护人员。
3. 生物安全柜是一种在生物医学、微生物学、生物制品等等一些领域的实验、检验、科研、教育以及在生产过程中应用到的安全洁净设备，同时也是实验室内生物安全中一级防护屏幕中基础的安全防护设备。
4. 从洁净度上来说，生物安全柜要比超净工作台要高。超净工作台的优点在于操作比较简单。
5、生物安全柜是往里面吸空气，防止生物病菌或试剂溅出安全柜污染实验室和实验员，主要用来保护人体。
6、而超净工作台是往外吹风，不考虑实验室和实验员，是保证试验台无菌环境的仪器。
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