高效气相色谱仪故障种类有气路部分故障、主机电路部分故障、检测器输出信号不正常和其它故障。
基础：
输入与输出：
通常仪器的每个部分、部件甚至零件都有它的输入和输出。
输入一般指该部分正常工作的前提，输出一般指该部分所起的作用或功能。
例如FID放大器。
它的输入是FID检测器通过信号线传送过来的微电流信号、放大器的工作电源、放大器的调零电位器，它的输出是经过放大并送到二次仪表的电信号。
判别FID放大器是否工作正常的方法：
1、如果输入正常而输出不正常，则放大器故障。
2、如果输入输出均正常，则放大器正常。
3、如果输入不正常，则放大器是否正常无法判定。
收集与积累：
积极收集、认真记录、不断积累仪器各个部分工作正常与否的各种判别方法，并了解、熟悉、掌握、牢记这些故障判别方法。
高效气相色谱仪电子压力流量控制（EPC）是在高效气相色谱仪分析中采用电子压力传感器和电子流量控制器，通过计算机实现压力和流量的自动控制技术。EPC具有以下特点：
一、流量控制准确，重现性好：
由载气流量变化引起的保留时间误差＜0.02%RSD。
二、可实现载气的多模式操作：
可实现恒流操作、恒压操作和压力编程操作，对优化分离更为有利。
三、仪器体积更小：
不需要各种机械阀和压力表，使仪器更为简洁，不存在机械阀故障问题。
四、自动化程度更高：
操作人员只需通过计算机输入色谱柱尺寸、流量（流速）和柱前压，软件会自动计算并设置各个参数，使GC工作效率更高。对于高要求的分析，需要对EPC定期进行校正。
五、具有节省气体的功能：
当一段时间不进样分析时，仪器可自动开启省气体功能，将载气流速降低（具体数值可设定）。当需要进样分析时，仪器在几秒钟之内可恢复原来的条件。
六、操作更安全：
EPC可自动检测GC系统内的漏气，当检测到压力意外下降时，会自动切断有关气体或所有气体，同时报警。
七、分析结果更可靠：
EPC会将分析过程中各种气体的压力和流量参数自动记录下来，实验人员可据此判断分析条件有无变化，从而判断分析结果的可靠性。若分析结果有问题，可通过检查这些原始记录找到原因。
高效气相色谱仪分析中保留时间漂移的原因及处理方法：
一、可能原因：温度变化。
处理方法：检查柱温箱的温度。
二、可能原因：气体流速变化。
处理方法：注射甲烷，测定载气线速度。
三、可能原因：进样口泄露。
处理方法：检查进样垫，判断其它泄露处。
四、可能原因：溶剂条件变化。
处理方法：样品和标准品使用相同的溶剂。
五、可能原因：色谱柱被污染。
处理方法：切除柱头10cm；高温老化，清洗。
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